Molekularna karakterizacija sira pripremljenog u domaćinstvu
Molecular characterization of semi-hard homemade cheese microflora
Чланак у часопису (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
U poslednjoj deceniji zabeležen je nagli razvoj molekularnih tehnika baziranih na 16S i 23S rRNK, koje se koriste u izučavanju biodiverziteta mikroorganizama. U ovom radu ispitivana je mikroflora polutvrdog sira pripremljenog u domaćinstvu. Zbog visokog sadržaja masti u ovom siru razvili smo novu tehniku za izolaciju totalne DNK iz sira (metod je baziran na bead beating-u). Brza izolacija DNK iz mikroflore sira omogućila nam je molekularnu identifikaciju BMK (BAKTERIJE MLEČNE KISELINE) na osnovu umnožavanja gena za 16S rRNK PCR metodom. Za umnožavanje su korišćeni prajmeri specifični za gene 16S rRNK lakto-bacila, ali su uslovi PCR reakcije bili takvi da su omogućavali i umnožavanje gena 16S rRNK laktokoka. Rezultati RFLP analize pokazali su da mikrofloru sira pripremljenog u domaćinstvu čine predominantno laktokoke.
This decade has shown an impressive development in the application of molecular techniques based on 16S and 23S rRNA genes to study the microbial diversity in various ecosystems. Microflora of semi-hard homemade cheese was examined in this work. We developed a novel technique for DNA extraction (a bead beating based method) due to high fat content of this cheese. Rapid extraction of DNA from cheese microflora enabled a molecular identification of the LAB (Lactic Acid Bacteria) strains based on PCR amplification of 16S RNA coding sequences. The specific primers for 76S RNA gene of lactobacilli were used for amplification. The PCR reaction was performed at lower temperature, where the specificity of the annealing reaction was reduced and lactococcal sequences of 16S RNA genes were also amplified. The results of RFLP analysis revealed that the microflora of Doboj homemade cheese encompases mostly lactococci.
Кључне речи:
RFLP / PCR / LAB / DNA / cheeseИзвор:
Acta Veterinaria-Beograd, 2005, 55, 5-6, 511-519Издавач:
- Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd
DOI: 10.2298/AVB0506511J
ISSN: 0567-8315
WoS: 000234035600017
Scopus: 2-s2.0-29344455186
Институција/група
TorlakTY - JOUR AU - Jovčić, Branko AU - Golić, Nataša AU - Kojić, Milan AU - Topisirović, Ljubiša PY - 2005 UR - http://intor.torlakinstitut.com/handle/123456789/801 AB - U poslednjoj deceniji zabeležen je nagli razvoj molekularnih tehnika baziranih na 16S i 23S rRNK, koje se koriste u izučavanju biodiverziteta mikroorganizama. U ovom radu ispitivana je mikroflora polutvrdog sira pripremljenog u domaćinstvu. Zbog visokog sadržaja masti u ovom siru razvili smo novu tehniku za izolaciju totalne DNK iz sira (metod je baziran na bead beating-u). Brza izolacija DNK iz mikroflore sira omogućila nam je molekularnu identifikaciju BMK (BAKTERIJE MLEČNE KISELINE) na osnovu umnožavanja gena za 16S rRNK PCR metodom. Za umnožavanje su korišćeni prajmeri specifični za gene 16S rRNK lakto-bacila, ali su uslovi PCR reakcije bili takvi da su omogućavali i umnožavanje gena 16S rRNK laktokoka. Rezultati RFLP analize pokazali su da mikrofloru sira pripremljenog u domaćinstvu čine predominantno laktokoke. AB - This decade has shown an impressive development in the application of molecular techniques based on 16S and 23S rRNA genes to study the microbial diversity in various ecosystems. Microflora of semi-hard homemade cheese was examined in this work. We developed a novel technique for DNA extraction (a bead beating based method) due to high fat content of this cheese. Rapid extraction of DNA from cheese microflora enabled a molecular identification of the LAB (Lactic Acid Bacteria) strains based on PCR amplification of 16S RNA coding sequences. The specific primers for 76S RNA gene of lactobacilli were used for amplification. The PCR reaction was performed at lower temperature, where the specificity of the annealing reaction was reduced and lactococcal sequences of 16S RNA genes were also amplified. The results of RFLP analysis revealed that the microflora of Doboj homemade cheese encompases mostly lactococci. PB - Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd T2 - Acta Veterinaria-Beograd T1 - Molekularna karakterizacija sira pripremljenog u domaćinstvu T1 - Molecular characterization of semi-hard homemade cheese microflora EP - 519 IS - 5-6 SP - 511 VL - 55 DO - 10.2298/AVB0506511J ER -
@article{ author = "Jovčić, Branko and Golić, Nataša and Kojić, Milan and Topisirović, Ljubiša", year = "2005", abstract = "U poslednjoj deceniji zabeležen je nagli razvoj molekularnih tehnika baziranih na 16S i 23S rRNK, koje se koriste u izučavanju biodiverziteta mikroorganizama. U ovom radu ispitivana je mikroflora polutvrdog sira pripremljenog u domaćinstvu. Zbog visokog sadržaja masti u ovom siru razvili smo novu tehniku za izolaciju totalne DNK iz sira (metod je baziran na bead beating-u). Brza izolacija DNK iz mikroflore sira omogućila nam je molekularnu identifikaciju BMK (BAKTERIJE MLEČNE KISELINE) na osnovu umnožavanja gena za 16S rRNK PCR metodom. Za umnožavanje su korišćeni prajmeri specifični za gene 16S rRNK lakto-bacila, ali su uslovi PCR reakcije bili takvi da su omogućavali i umnožavanje gena 16S rRNK laktokoka. Rezultati RFLP analize pokazali su da mikrofloru sira pripremljenog u domaćinstvu čine predominantno laktokoke., This decade has shown an impressive development in the application of molecular techniques based on 16S and 23S rRNA genes to study the microbial diversity in various ecosystems. Microflora of semi-hard homemade cheese was examined in this work. We developed a novel technique for DNA extraction (a bead beating based method) due to high fat content of this cheese. Rapid extraction of DNA from cheese microflora enabled a molecular identification of the LAB (Lactic Acid Bacteria) strains based on PCR amplification of 16S RNA coding sequences. The specific primers for 76S RNA gene of lactobacilli were used for amplification. The PCR reaction was performed at lower temperature, where the specificity of the annealing reaction was reduced and lactococcal sequences of 16S RNA genes were also amplified. The results of RFLP analysis revealed that the microflora of Doboj homemade cheese encompases mostly lactococci.", publisher = "Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd", journal = "Acta Veterinaria-Beograd", title = "Molekularna karakterizacija sira pripremljenog u domaćinstvu, Molecular characterization of semi-hard homemade cheese microflora", pages = "519-511", number = "5-6", volume = "55", doi = "10.2298/AVB0506511J" }
Jovčić, B., Golić, N., Kojić, M.,& Topisirović, L.. (2005). Molekularna karakterizacija sira pripremljenog u domaćinstvu. in Acta Veterinaria-Beograd Univerzitet u Beogradu - Fakultet veterinarske medicine, Beograd., 55(5-6), 511-519. https://doi.org/10.2298/AVB0506511J
Jovčić B, Golić N, Kojić M, Topisirović L. Molekularna karakterizacija sira pripremljenog u domaćinstvu. in Acta Veterinaria-Beograd. 2005;55(5-6):511-519. doi:10.2298/AVB0506511J .
Jovčić, Branko, Golić, Nataša, Kojić, Milan, Topisirović, Ljubiša, "Molekularna karakterizacija sira pripremljenog u domaćinstvu" in Acta Veterinaria-Beograd, 55, no. 5-6 (2005):511-519, https://doi.org/10.2298/AVB0506511J . .